一号文发布后，2月6日，农业部印发《关于推进农业供给侧结构性改革的实施意见》(下称“《意见》”)。作为一号文的后续配套文件，《意见》指出，推进农业供给侧结构性改革，是农业农村经济工作主线，《意见》中对稳定粮食生产、推进结构调整等六大重点任务作出具体要求。

多家机构看好农业供给侧结构性改革下的主题投资机会，据21世纪经济报道记者梳理，其中土地流转、农业现代化、种业粮食等细分领域被重点关注。

安信证券认为，农业供给侧改革是一个难得的既有政策大力支持且又符合产业趋势的主题机会。除了关注类似工业供给侧带来的涨价逻辑的玉米产业链、饲料产业链外，还看好土地流转，这是农业供给侧改革的重要组成部分，而今年农村土地流转会加速推行，相关产业有望在政策助力下迎来重要机遇。

“农业供给侧改革不仅仅是对应工业供给侧改革，简单去产能去库存，同时也要推进规模化经营，提高生产效率，因此对应土地流转、农业信息化、农业节水等全面改革，相关农业、化工、计算机等公司都会有相关收益。”安信证券一位分析师表示。

广发证券认为，改革的本质体现为确保粮食安全、农民增收、去库存的基础之上推进农业现代化与规模化。短期建议关注玉米去库存和土地流转；中长期来看，农业现代化与规模化，相关产业如高端农业机械、农业信息化、生物育种及新型化肥、农药等细分领域均将受益。

方正证券任泽平团队认为，农业供给侧结构性改革的本质在于以改革推动农业农村发展从过度依赖资源消耗向绿色生态可持续转变，主要满足“量”的需求向注重满足“质”的需求转变。其认为，可重点关注土地流转、禽畜养殖、现代种业、农田水利基建、化肥农药、绿色环保农机等六大投资主题。